圣帝独裁万界，生灵涂炭。为拯救天下苍生聂离孤身挑战，惨死于六只神级妖兽的围攻之下。圣物时空妖灵之书给在聂离弥留之际，将他带回了童年时期，给了聂离重头再来的机会。涅槃重生，聂离决定从改变光辉之城覆灭的命运开始，拯救身边的人。为了阻止兽潮攻陷光辉之城，聂离开始了与兽潮元凶“黑暗公会”以及与其勾结的神圣世家的长期斗争。

战后复兴的东京，、少年侦探金田正太郎和他的“铁人28号”一起解决了一个接着一个的困难事件。但是在战争中行踪不明的正太郎的哥哥出现在了正太郎面前。（正太郎的哥哥也叫正太郎，故下面用SHOUTAROU代替